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Hee-Jin Park

Hanyang University · Computer Science

About the Lab

Professor Hee-Jin Park's research lab specializes in computational and systems biology, with a focus on integrative 'omics' data analysis—particularly proteogenomics and financial accounting informatics. The lab develops advanced bioinformatics pipelines for accurate protein identification using customized, compact databases derived from RNA-seq and exome data, emphasizing efficient and sensitive search strategies that reduce computational overhead without sacrificing accuracy. In parallel, the lab investigates the economic implications of financial reporting transparency, earnings quality, and market efficiency, especially in the context of accounting standard changes and information asymmetry. These dual research directions reflect a strong commitment to both biological data innovation and financial information utility.

proteogenomicsdatabase constructionfalse discovery ratefinancial reporting qualityearnings transparency

Research Overview

Papers
164
Total Citations
1,468
Papers (5y)
27
Primary Field
Computer Science

Research Output Trend

Figures are computed from collected data and may differ slightly.

Publications per year (5y)
27total
2022
2023
2024
2025
2026
Citations per year (5y)
103total
20222023202420252026

Selected Papers

15
1
Article|92 citations·2004
Constructing suffix arrays in linear time
Dong Kyue Kim, Jeong Seop Sim, Heejin Park, Kunsoo Park
Journal of Discrete Algorithms
Artificial IntelligenceComputer Science
2
Article|36 citations·2014
Compact variant‐rich customized sequence database and a fast and sensitive database search for efficient proteogenomic analyses
Heejin Park, Junwoo Bae, Hyunwoo Kim, Sangok Kim, Hokeun Kim, Dong‐Gi Mun, Yoonsung Joh, Wonyeop Lee, Sehyun Chae, Sanghyuk Lee, Hark Kyun Kim, Daehee Hwang
SJR Q2PROTEOMICS

In proteogenomic analysis, construction of a compact, customized database from mRNA-seq data and a sensitive search of both reference and customized databases are essential to accurately determine protein abundances and structural variations at the protein level. However, these tasks have not been systematically explored, but rather performed in an ad-hoc fashion. Here, we present an effective method for constructing a compact database containing comprehensive sequences of sample-specific varian

Molecular BiologyBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
3
Article|35 citations·2001
Parallel algorithms for red–black trees
Heejin Park, Kunsoo Park
SJR Q2Theoretical Computer Science
Artificial IntelligenceComputer Science
4
Article|18 citations·2019
Target-small decoy search strategy for false discovery rate estimation
Hyunwoo Kim, Sangjeong Lee, Heejin Park
SJR Q1BMC BioinformaticsOA

BACKGROUND: One of the most important steps in peptide identification is to estimate the false discovery rate (FDR). The most commonly used method for estimating FDR is the target-decoy search strategy (TDS). While this method is simple and effective, it is time/space-inefficient because it searches a database that is twice as large as the original protein database. This inefficiency problem becomes more evident as protein databases get bigger and bigger. We propose a target-small decoy search s

SpectroscopyChemistry
5
Article|18 citations·2014
이익투명성 및 정보비대칭과 자기자본비용
박희진, 신호영, 고종권
http://www.kaa-edu.or.kr/journal/report/list2.php?page=1&keyfield=&key=&gubun=4&year=2014&monthv=August&vol=23&no=4

본 연구의 목적은 이익투명성이 높은 기업일수록 낮은 자본비용을 부담하는지를 살펴보는 것이다. 아울러 기업집단 소속여부와 정보비대칭 수준에 따라 이익투명성이 자본비용에 미치는 영향이 달라지는지를 분석한다. 이익투명성이 높다는 것은 이익정보가 기업의 경제적 가치의 변화를 잘 설명한다는 것으로 정의할 수 있으며, 본 연구에서는 Cheng and Subramanyam(2008)과 Barth et al.(2013)이 제시한 방법으로 이익투명성을 측정한다. 재무제표는 기업과 시장참여자 간의 정보비대칭을 완화하는 역할을 수행함으로써 기업의 정보위험을 감소시키는 역할을 수행한다. 재무제표에 보고되는 회계정보가 기업의 경제적 가치변화를 효과적으로 설명한다면 정보유용성은 증가할 것이며, 회계정보는 경제적 자원의 효율적 배분기능에 기여할 것이다. 투명성이 높은 이익정보가 기업의 경제적 가치변화를 보다 잘 설명한다면 이익투명성이 높을수록 기업의 불확실성에 따른 정보위험이 감소하기 때문에 시장참여자들이 요

6
Article|18 citations·2015
재무이익-세무이익의 일치성, 보고이익 차이의 일관성과 이익의 정보효과
박희진, 정석윤, 고종권
http://www.kaa-edu.or.kr/journal/report/list2.php?page=1&keyfield=&key=&gubun=1&year=2015&monthv=October&vol=40&no=5

본 연구는 외환위기 전과 후로 구분하여 재무이익과 세무이익의 정보효과 뿐만 아니라 이익조정과 세무계획이 재무이익과 세무이익의 정보효과에 미치는 영향을 개별효과와 교차효과로 구분하여 분석하였다. 아울러 보고이익의 일치성과 보고이익 차이의 일관성이 재무이익과 세무이익의 정보효과에 미치는 영향을 분석하였다. 분석결과는 다음과 같다. 첫째, 재무이익의 정보효과는 일관되게 양(+)으로 나타났으나 세무이익의 정보효과는 외환위기 전에는 음(-)인 반면 외환위기 후에는 양(+)으로 반전하였다. 이는 외환위기라는 경제적 사건 이후 자본시장 참여자들이 경영자의 재량권이 적은 세법에 의해 산출된 세무이익을 기업의 성과를 평가하는데 이용하고 있음을 시사한다. 둘째, 이익조정 수준이 높을수록 재무이익의 정보효과는 감소하고 세무계획 수준이 높을수록 세무이익의 정보효과는 감소하는 것으로 나타나 개별효과가 존재하였다. 그러나 이익조정이 세무이익의 정보효과에 미치는 교차효과는 존재하지 않고 세무계획이 재무이익의

7
Article|15 citations·2008
Protocol completion incentive problems in cryptographic Vickrey auctions
Phillip G. Bradford, Sunju Park, Michael H. Rothkopf, Heejin Park
SJR Q1Electronic Commerce Research
Artificial IntelligenceComputer Science
8
Article|14 citations·2007
Linearized Suffix Tree: an Efficient Index Data Structure with the Capabilities of Suffix Trees and Suffix Arrays
Dong Kyue Kim, Min Hwan Kim, Heejin Park
SJR Q1Algorithmica
Artificial IntelligenceComputer Science
9
Article|14 citations·2011
Efficient algorithms for consensus string problems minimizing both distance sum and radius
Amihood Amir, Gad M. Landau, Joong Chae Na, Heejin Park, Kunsoo Park, Jeong Seop Sim
SJR Q2Theoretical Computer Science
Computational Theory and MathematicsComputer Science
10
Article|14 citations·2015
NextSearch: A Search Engine for Mass Spectrometry Data against a Compact Nucleotide Exon Graph
Hyunwoo Kim, Heejin Park, Eunok Paek
SJR Q1Journal of Proteome Research

Proteogenomics research has been using six-frame translation of the whole genome or amino acid exon graphs to overcome the limitations of reference protein sequence database; however, six-frame translation is not suitable for annotating genes that span over multiple exons, and amino acid exon graphs are not convenient to represent novel splice variants and exon skipping events between exons of incompatible reading frames. We propose a proteogenomic pipeline NextSearch (Nucleotide EXon-graph Tran

SpectroscopyChemistry
11
Article|13 citations·2017
기타포괄손익과 미래이익 변동성, 투자자의 의견차이 및 자본비용
박희진, 신호영
http://www.kaa-edu.or.kr/html/sub03_03.asp

본 연구의 목적은 기타포괄손익정보에 대한 자본시장의 반응을 미래이익의 변동성, 투자자의 의견차이 및 자본비용의 관점에서 종합적으로 분석하는 것이다. 우리나라의 기타포괄손익 보고방법은 2007년도를 기준으로 자본조정 공시에서 손익계산서 주석공시로 변경되었으며, 한국채택국제회계기준(이하 ‘K-IFRS’)이 전면 도입된 2011년도를 기준으로 주석공시에서 포괄손익계산서상의 본문표시로 변경되었다. 기업의 경영성과를 나타내는 재무제표가 손익계산서에서 포괄손익계산서로 변경되면서 당기순이익과 총포괄이익의 가장 큰 차이라 할 수 있는 기타포괄손익의 인식여부, 보고방법 등은 회계정보의 유용성을 분석하는 연구분야에서 주된 관심의 대상이 되었다. 이후 2012년 1월에 K-IFRS 제1001호를 개정하면서 우리나라도 포괄손익계산서에 기타포괄손익 항목들을 후속기간에 당기손익으로 재분류되는 항목과 재분류되지 않는 항목으로 구분 표시하도록 규정하였다. 이로 인해 시장참여자들은 재무제표 본문을 통해 실현이익인

12
Article|13 citations·2015
재무제표 비교가능성 및 초도감사 여부와 감사품질
박희진, 이세철
회계ㆍ세무와 감사 연구

재무보고의 개념체계에 의하면 재무제표 비교가능성은 재무정보가 유용하기 위한 질적 특성 가운데 보강적 질적 특성으로 규정되어 있다. 비교가능성이 높다는 것은 정보이용자가 기업 간 또는 기간 별 비교를 통해 재무제표에 함축되어 있는 다양한 재무정보와 이익의 근본적 질적 속성을 이해하는데 도움이 된다는 것을 의미한다. 감사인의 입장에서는 재무제표의 비교가능성이 높은 경우에 효율적이고 효과적으로 감사위험 요소를 파악함으로써 감사품질이 향상될 수 있을 것이다. 특히, 감사대상회사의 회사와 사업에 대한 이해가 부족한 초도감사에서 재무제표 비교가능성의 중요성은 더욱 증가할 것으로 기대된다. 이러한 논의에서 본 연구는 감사대상회사의 재무제표 비교가능성이 높을수록 감사품질이 향상되는지와 초도감사 여부에 따라 재무제표 비교가능성이 감사품질에 미치는 영향이 달라지는지를 살펴본다. De Franco et al.(2011)의 방법으로 재무제표 비교가능성을 측정한다. 분석결과, 재무제표 비교가능성이 높은 기

13
Article|11 citations·2017
Dielectric cure determination of a thermosetting epoxy composite prepreg
Heejin Park
SJR Q2Journal of Applied Polymer Science

ABSTRACT Evaluation of degree of cure (DoC) of a glass reinforced epoxy composite prepreg used for manufacturing of printed circuit board (PCB) is an intensive issue because of its practical importance and cost reduction in industry. Typical techniques such as differential scanning calorimetry (DSC) and fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) are destructive and require curing a material during a chosen time, quenching the sample to stop cure before performing analysis. Thus, it is necess

Mechanical EngineeringEngineering
14
Article|9 citations·2018
iMGEins: detecting novel mobile genetic elements inserted in individual genomes
Junwoo Bae, Kyeong Won Lee, Mohammad Nazrul Islam, Hyung‐Soon Yim, Heejin Park, Mina Rho
SJR Q1BMC GenomicsOA

BACKGROUND: Recent advances in sequencing technology have allowed us to investigate personal genomes to find structural variations, which have been studied extensively to identify their association with the physiology of diseases such as cancer. In particular, mobile genetic elements (MGEs) are one of the major constituents of the human genomes, and cause genome instability by insertion, mutation, and rearrangement. RESULT: We have developed a new program, iMGEins, to identify such novel MGEs by

GeneticsBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
15
Article|9 citations·2012
경영자이익예측 정확성과 자기자본비용
박희진, 신호영

본 연구는 2002년 11월에 도입된 공정공시제도를 통해 보고된 경영자이익예측정보의 정확성이 자기자본비용에 미치는 영향을 분석한다. 자기자본비용은 크게 무위험수익률과 위험프리미엄으로 구성되므로 경영자예측정보의 정확성이 높을수록 불확실성에 대한 위험프리미엄이 낮아져 자기자본 하락으로 이어질 것이다. 자기자본비용을 추정하기 위해 Easton(2004)가 제시한 PEG모형, MPEG모형과 Ohlson and Juettner-Nauroth(2005)의 GM모형을 이용하였다. 2002년부터 2009년까지 상장기업을 대상으로 분석한 결과, 경영자이익예측정보의 정확성이 높을수록 자본비용이 감소하였다. 이러한 결과는 자율공시 정보라 하더라도 경영자가 정확한 이익예측정보를 제공해야 하는 이유를 제시하고 있으며, 경영자들에게 중요한 시사점을 제공한다.

Research Areas

Artificial IntelligenceSociology and Political ScienceInformation SystemsSpectroscopyBiomedical EngineeringEducation

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