[论文解读] Construction of warped time-frequency representations on nonuniform frequency scales, Part I: Frames

Nicki Holighaus, Christoph Wiesmeyr|arXiv (Cornell University)|Sep 25, 2014

Image and Signal Denoising Methods参考文献 57被引用 6

一句话总结

本文研究了近交小鼠品系对旋毛虫（Trichinella spiralis）感染的遗传易感性控制机制，发现即使H-2单倍型相同，不同品系之间的抗性差异表明，主要组织相容性复合体（MHC）以外的基因座控制着易感性。具有H-2k单倍型的小鼠品系最易感，而H-2q品系最抗性，为实验选择提供了易感性排序框架。

ABSTRACT

Twenty-eight different inbred strains of mice representing five different H-2 haplotypes were compared for degree of susceptibility to a primary infection with Trichinella spiralis. Marked differences in susceptibility, measured by the average number of muscle larvae per host, were seen among strains of mice sharing common H-2 alleles. The genes controlling these differences must therefore map at loci outside the major histocompatibility complex. Strains of mice sharing the H-2k haplotype were generally more susceptible than strains expressing other haplotypes and strains expressing H-2q alleles were most resistant. Strains of mice were ranked in order of decreasing susceptibility. Knowledge of these ranking may be of value to researchers wishing to select strains of mice appropriate for studies on T. spiralis.

研究动机与目标

• 确定MHC以外的遗传因素是否影响近交小鼠品系对旋毛虫（Trichinella spiralis）感染的易感性。
• 比较共享相同H-2单倍型品系之间的易感性水平，以分离非MHC遗传基因座。
• 根据易感性对小鼠品系进行排序，以供未来寄生虫学和免疫学研究使用。
• 识别品系特异性的抗性模式，以指导宿主-病原体相互作用研究。

提出的方法

• 使用代表五种H-2单倍型的28个近交小鼠品系，感染旋毛虫（Trichinella spiralis）。
• 以每只宿主的肌肉幼虫平均数量作为易感性的主要衡量指标。
• 按H-2单倍型（如H-2k、H-2q）对品系进行分组，以比较单倍型内和单倍型间的易感性。
• 使用统计比较方法评估具有相同H-2等位基因的品系之间幼虫负荷的差异。
• 根据幼虫计数结果，按易感性递减顺序对品系进行排序。
• 分析重点在于通过观察H-2一致组内的变异，识别非MHC的遗传控制机制。

实验结果

研究问题

• RQ1 具有相同H-2单倍型的小鼠品系是否在旋毛虫（Trichinella spiralis）感染的易感性上表现出显著差异？
• RQ2 是否存在MHC以外的遗传基因座影响对T. spiralis感染的抗性？
• RQ3 在本研究的近交小鼠品系中，哪种H-2单倍型与最高或最低易感性相关？
• RQ4 能否为实验用途建立一个可靠的按易感性排序的小鼠品系体系？
• RQ5 在T. spiralis感染背景下，H-2q与H-2k品系的相对抗性水平如何？

主要发现

• 共享相同H-2单倍型的品系表现出显著的易感性差异，表明非MHC基因控制着对旋毛虫（Trichinella spiralis）的抗性。
• 携带H-2k单倍型的小鼠普遍比其他单倍型更易感。
• 携带H-2q单倍型的小鼠在所有测试品系中最为抗性。
• H-2k组的肌肉幼虫平均负荷最高，而H-2q组最低。
• 已建立按易感性递减顺序排列的小鼠品系排序，可为未来研究提供选择指导。
• 数据表明，抗性遗传控制不仅限于MHC，还涉及MHC以外的其他基因座，参与宿主对T. spiralis的防御。