Jungmin Choi
고려대학교 의과대학 · 의학
Jungmin Choi 교수의 연구실은 주로 암 유전자 기반의 분자 기반 연구를 중심으로, 자궁 평滑근종세포에서의 유전적 변이와 병변 기반의 분자 메커니즘을 규명하고 있습니다. 특히 전장 염기서열 분석(WES, WGS, RNA-Seq)을 활용해 TP53, PTEN, MED12 등 핵심 유전자와 lncRNA, 페시드오지 유전자 등 비코딩 유전자 기반의 암 저항성 및 진행 메커니즘을 탐색하고 있습니다. 또한, 간세포질암(HCC)과 같은 암에서의 화학요법 저항성 메커니즘 규명을 위해 TCGA 데이터 기반 생물정보학적 분석과 실험적 검증을 융합한 연구를 수행하고 있습니다. 연구는 암의 분자 기반 진단 및 표적 치료 전략 개발에 기여하고자 합니다.
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.
Uterine leiomyosarcomas (uLMS) are aggressive tumors arising from the smooth muscle layer of the uterus. We analyzed 83 uLMS sample genetics, including 56 from Yale and 27 from The Cancer Genome Atlas (TCGA). Among them, a total of 55 Yale samples including two patient-derived xenografts (PDXs) and 27 TCGA samples have whole-exome sequencing (WES) data; 10 Yale and 27 TCGA samples have RNA-sequencing (RNA-Seq) data; and 11 Yale and 10 TCGA samples have whole-genome sequencing (WGS) data. We foun
The decoding of the Tritryp reference genomes nearly 7 years ago provided a first peek into the biology of pathogenic trypanosomatids and a blueprint that has paved the way for genome-wide studies. Although 60-70% of the predicted protein coding genes in Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi and Leishmania major remain unannotated, the functional genomics landscape is rapidly changing. Facilitated by the advent of next-generation sequencing technologies, improved structural and functional annota
Hepatocellular carcinoma (HCC) records the second-lowest 5-year survival rate despite the avalanche of research into diagnosis and therapy. One of the major obstacles in treatment is chemoresistance to drugs such as 5-fluorouracil (5-FU), making identification and elucidation of chemoresistance regulators highly valuable. As the regulatory landscape grows to encompass non-coding genes such as long non-coding RNAs (lncRNAs), a relatively new class of lncRNA has emerged in the form of pseudogene-d