[論文レビュー] Developing the best practices for research software registries and repositories

Thomas E. Morrell, Alice Allen|arXiv (Cornell University)|Apr 2, 2021

Scientific Computing and Data Management被引用数 9

ひとこと要約

この論文は、研究ソフトウェアの発見可能性、透明性、長期的保存性を向上させるために、科学的ソフトウェアレジストリおよびリポジトリが実行可能な9つの実践的ベストプラクティスを提示する。FORCE11 ソフトウェア引用実装作業部会によって開発されたこのフレームワークは、範囲、著作者、メタデータ、使用方法、プライバシー、保持、リリース終了手順に関する公開ポリシーを策定するためのガイドラインを提供し、研究分野を越えて信頼性と持続可能性を確保する。

ABSTRACT

This talk, for the INCF Neuroinformatics Assembly 2021, discusses the Best Practices for Research Software Registries and Repositories" from the FORCE11 Software Citation Implementation Working Group Task Force. It outlines the development of the practices, a summary of each practice, and next steps. The full best practices are available in this preprint: A. Monteil, A. Gonzalez-Beltran, A. Ioannidis, A. Allen, A. Lee, A. Bandrowski, B. E. Wilson, B. Mecum, C. Fan Du, C. Robinson, D. Garijo, D. S. Katz, D. Long, G. Milliken, H. Ménager, J. Hausman, J. H. Spaaks, K. Fenlon, K. Vanderbilt, L. Hwang, L. Davis, M. Fenner, M. R. Crusoe, M. Hucka, M. Wu, N. Chue Hong, P. Teuben, S. Stall, S. Druskat, T. Carnevale, T. Morrell, "Nine Best Practices for Research Software Registries and Repositories: A Concise Guide," arXiv 2012.13117 [cs.DL], 2020.

研究の動機と目的

• 科学的ソフトウェアレジストリおよびリポジトリを構築・管理するための標準化されたガイドラインの欠如に対処する。
• ソフトウェアの発見、引用、保存に関するポリシーを形式化することで、研究の再現性と透明性を向上させる。
• 範囲、使用方法、ガバナンスに関する明確で公開可能なポリシーを通じて、ソフトウェア貢献者およびユーザーを支援する。
• 信頼性があり持続可能で、コミュニティから認められるソフトウェアリポジトリおよびレジストリの基盤を構築する。
• 多様な科学分野および技術的インフラに適用可能な実用的で合意形成に基づくフレームワークを提供する。

提案手法

• 月次会議および専用ワークショップを通じたレジストリおよびリポジトリ管理者間の反復的協働により、ベストプラクティスを統合的に抽出した。
• 天文学、バイオインフォマティクス、地球科学分野における既存のレジストリおよびリポジトリの実際の経験からガイドラインを導出した。
• 9つのコアポリシー分野を明文化した：範囲声明、ユーザー向けガイド、貢献者向けガイド、著作者ポリシー、メタデータスキーマ共有、使用条件、プライバシーポリシー、保持ポリシー、リリース終了ポリシー。
• FORCE11 ソフトウェア引用実装作業部会からのフィードバックを統合し、CoreTrustSealなどの包括的な信頼性基準と整合した。
• Zenodo、Dryad、CoMSES Net などの成熟したプラットフォームからの具体的なポリシー例およびテンプレートを提供した。
• 標準化されたメタデータスキーマ（例：JSON-LD、CiteAs、引用ファイル形式）およびコンテンツネゴシエーションのサポートを通じて、相互運用性を強化した。

実験結果

リサーチクエスチョン

• RQ1 研究ソフトウェアレジストリおよびリポジトリの長期的持続可能性と信頼性を確保するための核心的ポリシーは何か？
• RQ2 レジストリおよびリポジトリは、多様な科学分野においてソフトウェアの発見可能性と引用慣行をどのように改善できるか？
• RQ3 ソフトウェアリポジトリにおける貢献者およびユーザーの信頼を支えるために必要なガバナンスおよび透明性メカニズムは何か？
• RQ4 リポジトリは、データ保持、プライバシー、リリース終了の移行をどのように管理することで継続性と保存性を確保できるか？
• RQ5 標準化されたメタデータスキーマおよび使用ポリシーは、研究ソフトウェアの相互運用性と再利用をどのように促進するか？

主な発見

• 9つのベストプラクティスは、信頼性があり、合意形成に基づいた、研究ソフトウェアレジストリおよびリポジトリの構築・管理の包括的フレームワークを提供する。
• 公開された範囲声明は、ユーザーの期待を明確にし、特定のレジストリやリポジトリで受け入れられるソフトウェアの範囲についての混乱を顕著に減少させる。
• 明確な著作者および貢献者ポリシーは、共同開発における帰属付けを強化し、紛争の発生を低減する。
• メタデータスキーマの共有（例：Zenodo や Software Heritage で使用されるもの）により、ソフトウェアの相互運用性と機械による発見が可能になる。
• Dryad や Zenodo で採用されている保持およびリリース終了ポリシーは、保存済みソフトウェアアセットの長期的アクセスと継続性を保証する。
• プライバシー、使用条件、データライセンスに関するポリシーは、特に機微または個人情報を取り扱うリポジトリにおいて、法的遵守とユーザー信頼を確保するために不可欠である。