[论文解读] Improving Software Citation and Credit

Alice Allen, G. Bruce Berriman+9 more|arXiv (Cornell University)|Dec 24, 2015

Scientific Computing and Data Management被引用 8

一句话总结

本文提出了一套协调一致、由社区推动的框架，旨在通过倡导标准化引用实践、机构认可和平台集成，改善天文学等科研领域中的软件引用与署名。该框架为作者、出版商和存储库提供了可操作的建议，以确保软件得到正式引用、追踪和认可，关键成果包括减少引用差距，并通过政策和文化变革提升软件的可持续性。

ABSTRACT

The past year has seen movement on several fronts for improving software citation, including the Center for Open Science's Transparency and Openness Promotion (TOP) Guidelines, the Software Publishing Special Interest Group that was started at January's AAS meeting in Seattle at the request of that organization's Working Group on Astronomical Software, a Sloan-sponsored meeting at GitHub in San Francisco to begin work on a cohesive research software citation-enabling platform, the work of Force11 to "transform and improve" research communication, and WSSSPE's ongoing efforts that include software publication, citation, credit, and sustainability. Brief reports on these efforts were shared at the BoF, after which participants discussed ideas for improving software citation, generating a list of recommendations to the community of software authors, journal publishers, ADS, and research authors. The discussion, recommendations, and feedback will help form recommendations for software citation to those publishers represented in the Software Publishing Special Interest Group and the broader community.

研究动机与目标

• 解决尽管研究软件在科学工作流中被广泛使用，但其正式引用仍长期缺失的问题。
• 纠正软件常被提及却极少被引用的失衡现象，如DAOPHOT和AIPS/CASA的案例所示。
• 建立一个共享的软件引用框架，以支持可发现性、署名认可和长期可持续性。
• 推动出版商、存储库和机构采纳将软件视为可引用学术产出的政策。
• 在学术界促进文化变革，使软件贡献与传统出版物在终身教职和晋升评定中获得同等重视。

提出的方法

• 在ADASS会议上举办圆桌讨论（BoF）会，收集软件作者、出版商和研究人员对当前引用实践的意见。
• 综合多个倡议的建议，包括Force11、WSSSPE、TOP指南以及Sloan资助的GitHub会议。
• 使用协作式Google文档收集并完善社区关于引用方法和最佳实践的反馈。
• 倡导使用持久标识符（例如通过Zenodo、ASCL、互联网档案馆）代替直接的GitHub链接，以提升可引用性。
• 提出政策改革，例如取消参考文献的字数限制，以纳入软件引用。
• 鼓励机构在年度研究报告和晋升评估中报告软件贡献，并创建教育材料（如视频、维基）以标准化实践。

实验结果

研究问题

• RQ1 如何在科学各学科中实现软件引用的标准化，以确保对开发者的恰当署名？
• RQ2 需要哪些机构和出版政策来支持研究论文中软件的正式引用？
• RQ3 为何许多软件包在科学文献中被提及的次数远超其被引用的次数，这一差距如何弥合？
• RQ4 Zenodo、ASCL和互联网档案馆等存储库在实现可引用的软件发布中发挥什么作用？
• RQ5 如何在学术晋升和终身教职评审过程中认可并奖励软件贡献？

主要发现

• DAOPHOT软件说明论文有4,035次正式引用，但该软件在另外3,061篇论文中被提及却未被正式引用，凸显了显著的引用差距。
• 在提及VLA望远镜的22,000篇论文中，仅有68篇正式引用了AIPS，59篇引用了CASA，表明关键软件工具存在系统性引用不足。
• 要求作者将软件版权转让给出版商的做法被BoF参与者一致反对，主要出于对所有权和可持续性的担忧。
• 与会者建议使用Zenodo、ASCL和互联网档案馆等持久归档服务，替代直接的GitHub链接，以实现可引用的软件发布。
• 社区对在年度研究报告和晋升评估中正式认可软件贡献表现出强烈支持。
• 开发一个集成的软件引用支持平台被确定为优先事项，Force11、WSSSPE和软件出版专题兴趣小组正在开展持续合作。