[論文レビュー] Construction of warped time-frequency representations on nonuniform frequency scales, Part I: Frames

Nicki Holighaus, Christoph Wiesmeyr|arXiv (Cornell University)|Sep 25, 2014

Image and Signal Denoising Methods参考文献 57被引用数 6

ひとこと要約

この論文は、近交因性マウス系統におけるTrichinella spiralis感染に対する感受性の遺伝的制御を調査し、相同H-2ハプロタイプを持つ系統間で感受性の差が認められることから、主要組織適合性複合体（MHC）以外の遺伝座が感受性を支配していることを明らかにした。H-2kハプロタイプの系統が最も感受性が高く、H-2qハプロタイプの系統が最も抵抗性が強いことから、実験的選択のための感受性順位フレームワークが得られた。

ABSTRACT

Twenty-eight different inbred strains of mice representing five different H-2 haplotypes were compared for degree of susceptibility to a primary infection with Trichinella spiralis. Marked differences in susceptibility, measured by the average number of muscle larvae per host, were seen among strains of mice sharing common H-2 alleles. The genes controlling these differences must therefore map at loci outside the major histocompatibility complex. Strains of mice sharing the H-2k haplotype were generally more susceptible than strains expressing other haplotypes and strains expressing H-2q alleles were most resistant. Strains of mice were ranked in order of decreasing susceptibility. Knowledge of these ranking may be of value to researchers wishing to select strains of mice appropriate for studies on T. spiralis.

研究の動機と目的

• 近交因性マウス系統におけるTrichinella spiralis感染に対するMHC以外の遺伝的要因が感受性に影響するかどうかを特定すること。
• 同じH-2ハプロタイプを共有する系統間での感受性レベルを比較し、非MHC遺伝座を同定すること。
• 将来の寄生虫学的および免疫学的研究における使用を想定して、マウス系統を感受性の観点から順位付けすること。
• 宿主-病原体相互作用の研究に役立つ、系統特異的な抵抗性パターンを特定すること。

提案手法

• Trichinella spiralisに感染した28種の近交因性マウス系統（5つのH-2ハプロタイプを含む）が用いられた。
• 感受性の主な指標として、宿主1頭あたりの筋肉内ラリオール数が定量された。
• H-2ハプロタイプ（例：H-2k、H-2q）ごとに系統をグループ化し、ハプロタイプ内およびハプロタイプ間での感受性を比較した。
• 同じH-2アレルを有する系統間におけるラリオール負荷の差を評価するために統計的比較が行われた。
• ラリオール数に基づいて感受性の高い順に系統を順位付けした。
• 非MHC遺伝的制御を同定するために、H-2に一致するグループ内での変動を焦点とした分析が実施された。

実験結果

リサーチクエスチョン

• RQ1 同じH-2ハプロタイプを持つマウス系統は、Trichinella spiralisに対する感受性に顕著な差を示すか？
• RQ2 MHC以外の遺伝座は、T. spiralis感染に対する抵抗性に影響を及ぼすか？
• RQ3 この近交因性マウス系統パネルにおいて、最も感受性が高くもしくは最も抵抗性が高いH-2ハプロタイプはどれか？
• RQ4 将来的な実験的利用を想定して、マウス系統の感受性を信頼性高く順位付けできるか？
• RQ5 T. spiralis感染の文脈において、H-2qとH-2k系統の相対的抵抗性はどの程度か？

主な発見

• 同じH-2ハプロタイプを共有する系統は感受性に顕著な差を示し、これはTrichinella spiralisに対する抵抗性が非MHC遺伝子によって制御されていることを示している。
• H-2kハプロタイプを有するマウスは、他のハプロタイプと比較して一般的に感受性が高かった。
• H-2qハプロタイプを有するマウスは、全テスト系統の中で最も抵抗性が高かった。
• H-2k群は平均して最も高い筋肉内ラリオール負荷を示し、H-2q群は最も低い負荷を示した。
• 感受性の高い順にマウス系統を順位付けする明確なフレームワークが確立され、将来的な研究における選択を支援できる。
• データは、抵抗性の遺伝的制御がMHCを越えて拡張しており、T. spiralisに対する宿主防御に関与する追加の遺伝座が存在することを示している。