[論文レビュー] The Web of Life

Miguel A. Fortuna, Raúl Ortega+1 more|arXiv (Cornell University)|Mar 11, 2014

Plant and animal studies参考文献 7被引用数 4

ひとこと要約

The Web of Life は、Google マップとリレーショナルデータベースを活用して、生態的相互作用ネットワークを可視化およびダウンロードするためのウェブベースのプラットフォームです。ユーザーは使いやすいインターフェースを通じて、複数のフォーマットで種の相互作用データを検索・探索・取得でき、クロスプラットフォームでのアクセスと、JSONベースのウェブサービスによるプログラムによるデータ取得をサポートします。

ABSTRACT

The Web of Life (www.web-of-life.es) provides a graphical user interface, based on Google Maps, for easily visualizing and downloading data on ecological networks of species interactions. It is designed and implemented in a relational database management system, allowing sophisticated and user-friendly searching across networks. Users can access the database by any web browser using a variety of operating systems. Data can be downloaded in several common formats, and a data transmission webservice in JavaScript Object Notation is also provided.

研究の動機と目的

• 生態的相互作用ネットワークを可視化するためのアクセスしやすくインタラクティブなプラットフォームを構築すること。
• リレーショナルデータベースシステムを用いて、複雑な生態的データを検索・取得できるようにすること。
• 標準のウェブブラウザを通じて、クロスプラットフォームでの生態的データへのアクセスをサポートすること。
• 複数の標準フォーマットでデータを提供し、他のツールとの統合を可能にするプログラムによる JSON ウェブサービスを提供すること。

提案手法

• プラットフォームは、生態的相互作用データのストレージと整理にリレーショナルデータベース管理システムを用います。
• 直感的な空間的可視化のため、Google マップ上で構築されたグラフィカルユーザーインターフェースを実装しています。
• データベースの構造化クエリ機能を活用して、相互作用ネットワーク全体を横断する高度な検索が可能になります。
• 広範な利用性を実現するため、複数の一般的なファイルフォーマットでのデータエクスポートをサポートしています。
• JavaScript Object Notation (JSON) ウェブサービスにより、データセットへのプログラムによるアクセスが可能になっています。
• システムはあらゆるウェブブラウザからアクセス可能であり、オペレーティングシステムの違いを問わず互換性を確保しています。

実験結果

リサーチクエスチョン

• RQ1 どのようにすれば、ユーザーフレンドリーでインタラクティブな環境で、生態的相互作用ネットワークを効果的に可視化し、探索できるでしょうか？
• RQ2 多様な種の相互作用にわたり、複雑な生態的データを効率的に検索・取得するための方法は何か？
• RQ3 生態的ネットワークデータを、さまざまなプラットフォームやアプリケーションでアクセス可能で再利用可能にするにはどうすればよいか？
• RQ4 スケーラブルでウェブベースのアクセスを実現するための技術的アーキテクチャは、どのようなものか？

主な発見

• プラットフォームは、Google マップを活用したインタラクティブでマップベースのインターフェースにより、生態的ネットワークの可視化を成功裏に実現しました。
• リレーショナルデータベースのバックエンドを介して、ユーザーは生態的相互作用データに対して洗練された検索が可能です。
• 複数の標準フォーマットでのデータエクスポートをサポートしており、データの再利用性が向上しました。
• プログラムによるアクセスが可能な JSON ベースのウェブサービスが利用可能であり、他のツールとの統合を容易にしました。
• 標準のウェブブラウザを通じて、あらゆるオペレーティングシステムでプラットフォームにアクセス可能であり、広範な利用性が確保されています。
• リレーショナルデータベースのクエリ処理とウェブベースの可視化を統合することで、生態的データの探索に効率的なソリューションが提供されました。