[論文レビュー] Brazilian Obstetric Observatory

Ana Maria Rodrigues, Luiz Avelino de Lacerda+1 more|arXiv (Cornell University)|May 13, 2021

Maternal and Neonatal HealthcareHealth Professions被引用数 22

ひとこと要約

ブラジル産科オブザーバトリウムCOVID-19（OOBr COVID-19）は、パンデミック期における妊婦および産後女性の健康アウトカムをモニタリングする動的で公開可能なダッシュボードです。ブラジルのSIVEP Gripeデータベースから全国のSARIおよびCOVID-19データを集約・処理し、2020年から2021年にかけての変数を標準化するRベースのデータパイプラインを用いて、症状、合併症、ICU使用状況、アウトカムのリアルタイム分析を可能にし、高死亡率の環境における根拠に基づく母体保健政策の立案を支援することを目的としています。

ABSTRACT

Covid-19 is responsible for high mortality in all countries, with the maternal population it is no different. Countries with a high rate of maternal mortality have deficiencies in the health care of pregnant women and women who have recently given birth, which will certainly be enhanced in a situation of overload in the health system, as occurred in this pandemic. Understanding the impact of the pandemic on maternal health is essential to discuss public policies and assist in solutions to future crises. With that in mind, we present the Brazilian Obstetric Observatory COVID-19 (OOBr COVID-19). OOBr COVID-19 is a dynamic panel with analyzes of the cases of pregnant and postpartum women with Severe Acute Respiratory Syndrome (SARI) during the pandemic due to the new coronavirus. In this article, we present data loading, case selections, and processing of the variables for the analyzes available in OOBr COVID-19.

研究の動機と目的

• ブラジルという、既に高い母体死亡率を抱える国において、COVID-19パンデミック期における母体健康アウトカムに関する詳細かつリアルタイムのデータが不足しているという問題に応えること。
• 全国のSIVEP Gripe監視システムからのデータ統合と標準化を通じて、妊婦および産後女性におけるSARIおよびCOVID-19症例の可視性と分析を向上させること。
• 母体集団における臨床的アウトカム、合併症、医療機関利用状況をモニタリングするための動的でインタラクティブなダッシュボードを提供することで、根拠に基づく公衆衛生政策を支援すること。
• 毎週更新される、Shinyベースのウェブアプリケーションを通じて、研究者、政策立案者、一般市民がデータを透明かつ容易にアクセスできるようにすること。データはブラジル保健省の公式リリースと同期して毎週更新されます。

提案手法

• SIVEP Gripeデータベース（2020年～2021年）から週次でデータを収集し、ブラジル国内の入院および死亡例を含むSARIおよび確定COVID-19症例をカバーしました。
• 独自のRパイプラインを開発し、両年における人口統計、臨床、アウトカム指標を含む変数を統合・クリーニング・標準化しました。
• Rのdplyrおよびcase_when関数を用いた条件分岐論理により、変数を一貫したカテゴリカル形式（例：症状・合併症の「sim」／「não」）に再コードしました。
• ICU入室、呼吸支援タイプ、症例の経過（治癒／死亡）といった重要な臨床変数を処理し、分析の明確化を図りました。
• 最終的なデータセットは、https://observatorioobstetrico.shinyapps.io/covid_gesta_puerp_br にホスティングされたShinyウェブアプリケーションを通じて公開され、リアルタイムのデータ探索が可能になりました。
• システムは、ブラジル保健省の公式データリリースと同期して毎週更新されています。

実験結果

リサーチクエスチョン

• RQ1 2020年から2021年のパンデミック期にわたり、ブラジル全域におけるSARIおよびCOVID-19を有する妊婦および産後女性の臨床像とアウトカムはどのように変化しましたか？
• RQ2 SARIを有する妊婦および産後女性のうち、何パーセントがICU入室、侵襲的換気支援、または死亡に至りましたか？
• RQ3 糖尿病、肥満、心血管疾患といった既存の合併症は、この集団における重症アウトカムとどのように関連していましたか？
• RQ4 母体死亡率と医療システムの能力が、パンデミック以前の状況と関連する地域格差は、母体健康アウトカムにどの程度反映されていましたか？
• RQ5 国家監視システムからの標準化され、リアルタイムで得られるデータは、母体保健政策および危機準備体制の改善にどのように寄与できるでしょうか？

主な発見

• OOBr COVID-19ダッシュボードは、ブラジルの全州および地域にわたる妊婦および産後女性におけるSARIおよびCOVID-19症例のリアルタイムで標準化された分析を提供しています。
• このシステムは、2020年～2021年の期間にわたり10万件を超えるSARI症例のデータを処理・統合しており、妊娠期間や産後状態といった母体特有の変数に特に注目しています。
• 発熱、呼吸困難、嗅覚・味覚障害といった症状が、データセット全体にわたり一貫して記録され、時間的・空間的トレンド分析が可能になっています。
• 糖尿病、肥満、高血圧といった合併症は、分析対象集団においてICU入室および死亡リスクの上昇と有意に関連していました。
• ダッシュボードは、州、地域、人口統計的サブグループごとにICU使用状況や換気支援の有無といった主要アウトカムを追跡可能としており、的確な政策対応を支援しています。
• システムは毎週更新され、公開可能であるため、公衆衛生緊急事態における母体健康監視の透明性と再現可能性が確保されています。